在全球化背景下，微生物菌株作为重要的生物资源，其创新价值和商业潜力日益凸显。一项专利的诞生，始于对创新成果的清晰认知和价值评估。对于菌株而言，首先需要明确其是否具备新颖性、创造性和实用性这三项专利授权的核心要素。研究者需通过系统的文献检索和市场调研，确认该菌株在分类学特征、生理生化特性、功能应用等方面是否与现有技术存在本质区别，例如能否产生新的代谢产物、具有更高效的催化能力或在特定环境下表现出独特的耐受性。这一步骤中，可以借助科科豆、八月瓜等专业平台获取全球范围内的菌株相关专利和文献信息，确保研发成果的创新性不被现有技术覆盖。同时，还要考虑菌株的实际应用场景，比如在医药、农业、工业酶制剂等领域是否具有可产业化的潜力，这直接关系到后续专利保护的商业价值。
菌株的特殊性在于其生物材料属性，因此在申请专利前，必须完成生物材料的保藏。根据《国际承认用于专利程序的微生物保存布达佩斯条约》（简称布达佩斯条约），申请人需要将菌株提交至符合条件的国际保藏单位进行保藏，并获得保藏证明。这是因为专利文件中对菌株的文字描述往往难以让他人准确复现该菌株，保藏行为确保了公众在专利授权后能够获得该生物材料。我国的中国普通微生物菌种保藏管理中心（CGMCC）和中国典型培养物保藏中心（CCTCC）都是布达佩斯条约认可的生物材料保藏单位，研究者可根据菌株特性选择合适的机构。保藏完成后，保藏编号、保藏日期、保藏单位名称等信息需要准确无误地体现在专利申请文件中，这是菌株专利申请的必要前提。
完成前期准备工作后，选择合适的国际专利申请途径是关键环节。目前，国际上主要通过《专利合作条约》（PCT）途径或直接向目标国家/地区专利局提交申请。PCT途径因其便利性和广覆盖性，成为多数申请人的首选。通过PCT途径提交国际专利申请，申请人可以在首次提交申请后的30个月内（部分国家或地区可能更长），决定进入哪些国家或地区的国家阶段，从而为申请人争取到宝贵的时间来评估各目标市场的商业前景、筹集资金以及应对潜在的技术或法律挑战。在提交PCT国际申请时，需要准备符合PCT条约规定的申请文件，包括请求书、说明书、权利要求书、摘要、附图（如需要）以及生物材料保藏证明等。这些文件通常需要以中文或英文等国际通用语言撰写，并符合国际检索单位的格式要求。
PCT国际申请提交后，将进入国际阶段程序，主要包括国际检索和国际公布。国际检索单位（如中国国家知识产权局、欧洲专利局等）会对申请文件进行检索，出具国际检索报告和书面意见，指出申请中存在的现有技术和可能的缺陷。申请人可以根据国际检索报告和书面意见，对申请文件进行修改和完善，特别是针对权利要求书的保护范围进行调整，以提高专利授权的可能性。自优先权日起满18个月，该国际申请将由世界知识产权组织（WIPO）进行国际公布，使公众能够了解该专利申请的内容。此外，申请人还可以选择是否提出国际初步审查请求，国际初步审查单位会对申请的专利性进行进一步的评估，并出具国际初步审查报告，该报告虽然对各国专利局没有法律约束力，但通常会被各国专利局在国家阶段审查时参考，有助于加快审查进程。
当PCT国际申请进入国家阶段后，申请人需要根据目标国家或地区专利法的要求，办理进入手续，包括提交国家阶段请求书、缴纳相关费用、提供申请文件的该国语言译文等。不同国家或地区的专利局会依据其国内法对申请进行实质审查，审查内容通常包括新颖性、创造性、实用性以及申请文件的形式要求等。在这个阶段，申请人可能需要针对不同国家专利局的审查意见进行答复和修改，这就需要对目标国家的专利法律体系和审查实践有一定的了解。例如，某些国家对生物技术发明的专利保护范围可能有特殊限制，或者对实验数据的要求更为严格。因此，在国家阶段，建议申请人与当地有经验的专利代理人或律师合作，以确保能够有效应对审查过程中的各种问题，最大限度地争取专利授权。
除了PCT途径外，对于一些市场明确且希望尽快获得授权的申请人，也可以选择在首次提交国内专利申请（通常称为优先权申请）后的12个月内，直接向《保护工业产权巴黎公约》成员国的专利局提交专利申请，并要求优先权。这种方式的优势是可以更早地进入目标国家的审查程序，但缺点是需要同时处理多个国家的申请手续和审查意见，时间和费用成本可能相对较高。因此，申请人需要根据自身的研发进度、资金状况以及市场战略，综合权衡选择最适合的国际保护途径。
在整个菌株专利国际保护的过程中，持续的专利管理和监控也不可或缺。获得专利授权后，申请人需要按照各国家或地区的规定按时缴纳年费，以维持专利的有效性。同时，还需要密切关注市场动态和竞争对手的专利布局，防止他人侵犯自己的专利权，必要时采取法律手段维护自身权益。此外，对于具有重要战略意义的菌株专利，还可以考虑通过专利合作、许可转让等方式实现其商业价值最大化。
需要特别注意的是，不同国家和地区对于生物技术领域的专利保护政策和审查标准存在差异。例如，某些国家对于涉及基因编辑的菌株可能有更严格的审查要求，而另一些国家则对微生物在环境治理等领域的应用给予更多鼓励。因此，在制定国际专利保护策略时，申请人需要充分调研目标市场所在国家或地区的相关法律法规和产业政策，以便更好地规划专利布局，提高专利申请的成功率，并最终实现对菌株创新成果的有效保护。
菌株专利申请国际保护要经过哪些步骤？ 一般先提出国内申请，然后在优先权期限内通过《专利合作条约》（PCT）途径或直接向目标国家或地区提出国际申请，之后进行国际检索、国际公布，进入国家阶段后完成相应程序。 申请国际保护的费用大概是多少？ 费用因申请国家、代理机构收费标准等而异，包含官费、代理费等，具体要根据实际情况确定。 申请国际保护有时间限制吗？ 有，自国内申请日起12个月内可通过PCT途径提出国际申请。
有人认为只要在国内获得了菌株专利，就自然在国际上受到保护，这是错误的。专利具有地域性，国内专利只在国内受保护，要想在国际上获得保护，需按相应国家或地区的法律规定和程序提出申请。
《国际承认用于专利程序的微生物保存布达佩斯条约》
《专利合作条约》（PCT）
世界知识产权组织（WIPO）
《保护工业产权巴黎公约》
中国国家知识产权局